在植物學上，銀杏屬裸子植物，雌、雄花應稱為孢子囊、小孢子葉球；沒有果實，應為種子。

　　雌雄花均著生在短枝上，都沒有花萼、花瓣，均為綠色，與葉同時展開。

　　雌花，具一長柄，上載一對胚珠，形似火柴梗。單生于短枝頂端，與葉成螺旋狀排列，一般 2 ～ 4 朵，最多達 8 朵。不同地區的雌花生長習性不一樣，物候期可相差 25 天左右。據 1981 年在泰興市宣堡鎮崇西村定樹觀察： 3 月 20 日芽萌動， 4 月 12 日展葉，出現雌花， 4 月 23 日雌花吐“性水”，可授粉， 4 月 29 日至 5 月 1 日，珠孔漸小而干涸，為終花期， 5 月 1 日起開始落花。授粉后 4 ～ 5 個月才受精。

　　雄花為下垂的柔荑花序狀結構，其實是一朵花。每一短枝上著生 3 ～ 8 朵，每朵花有 30 ～ 50 枚雄蕊，每一枚雄蕊有一長 1 ～ 2mm 的柄，上有一對長形花藥。花藥極小，長約 2.60 ～ 3.64mm ，每一個花藥中含花粉粒 1500 ～ 1900 粒，這樣一朵花中就含有幾萬粒花粉粒（人工授粉時要千萬控制雄花用量，防止重載）。花藥成熟時開裂，散出花粉，花粉粒黃色，細小，隨風飄揚，在自然界，花粉靠風傳播授粉。干燥花粉的生命力，在常溫下可維持 15 天以上（時間越長，效果越差），在 0 ℃左右冷藏，可保持更長時間。在同一地區、同一品種的雄花成熟期比雌花早 2 ～ 5 天，雄株花期為 7 ～ 10 天，雌株略長。